Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'14-Hairpin pdb1kd11A.e317-332 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1kd1:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CO-CRYSTAL STRUCTURE OF SPIRAMYCIN BOUND TO THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT OF HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
Position | (317, 332) | ||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GAUACAGGGUGACA_ | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C2'-endo, 6: C2'-endo, 12: C2'-endo, 13: C2'-endo, 14: C1'-exo, 15: C2'-endo, 16: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 13: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |