Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-7-Internal Loop pdb1kc81A.n1819-1854 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1kc8:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CO-CRYSTAL STRUCTURE OF BLASTICIDIN S BOUND TO THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.01 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1825, 1848), (1831, 1840) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GCAAA_-_CUCGUAC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 3: C1'-exo, 4: C2'-endo, 10: C2'-endo, 11: C2'-endo, 13: C2'-endo, 14: C2'-endo, 15: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |