Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'3-5-Internal Loop pdb1kc81A.n1424-1459 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1kc8:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CO-CRYSTAL STRUCTURE OF BLASTICIDIN S BOUND TO THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.01 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1425, 1458), (1429, 1452) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UAA_-_GAAAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
8: C2'-endo, 9: C2'-endo, 11: C2'-endo, 12: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |