Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '7-Segment pdb1kc81A.i1490-1498 | |||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1kc8:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | CO-CRYSTAL STRUCTURE OF BLASTICIDIN S BOUND TO THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.01 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1490, 1498) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AGUGAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C3'-exo, 6: C2'-endo, 7: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn, 7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||