Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'11-Hairpin pdb1kc81A.e2163-2175 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1kc8:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CO-CRYSTAL STRUCTURE OF BLASTICIDIN S BOUND TO THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.01 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (2163, 2175) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GAAAAGAUAUC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C4'-exo, 12: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |