Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'9-Hairpin pdb1k9w1C.e7-17 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1k9w:C (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | HIV-1(MAL) RNA DIMERIZATION INITIATION SITE | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | HIV-1 DIS(MAL)UU RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.10 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
Position | (7, 17) | ||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGGUGCACA_ | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 9: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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Structural Clusters |