Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '9-Hairpin pdb1k9w1A.e7-17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1k9w:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | HIV-1(MAL) RNA DIMERIZATION INITIATION SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | HIV-1 DIS(MAL)UU RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.10 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (7, 17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _AGGUGCACA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||