Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'7-Hairpin pdb1k8w1B.e8-16 | |||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1k8w:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI PSEUDOURIDINE SYNTHASE TRUB BOUND TO A T STEM-LOOP RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 5'-R(*GP*GP*CP*AP*AP*CP*GP*GP*UP*(FHU) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 1.85 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (8, 16) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UUCGAUC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 3: C3'-exo, 4: C2'-endo, 5: C2'-endo, 6: C4'-exo, 8: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |