Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '19-Hairpin pdb1jzz1A.e2160-2180 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1jzz:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURAL BASIS FOR THE INTERACTION OF ANTIBIOTICS WITH THE PEPTIDYL TRANSFERASE CENTER IN EUBACTERIA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RRNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.80 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (2160, 2180) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CUCCCAAAAUGUAACGGAG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
8: syn, 9: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||