Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'17-Hairpin pdb1jbr1D.e7-25 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1jbr:D (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBOTOXIN RESTRICTOCIN AND A 31- MER SRD RNA INHIBITOR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 31-MER SRD RNA ANALOG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.15 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (7, 25) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UCAGUACGAGAGGAACC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C2'-endo, 5: C3'-exo, 10: C2'-endo, 11: C2'-endo, 12: O4'-exo, 15: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn, 11: syn, 12: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |