Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-4-Internal Loop pdb1j5e1A.n1230-1261 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1j5e:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.05 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (1232, 1259), (1235, 1254) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AU_-_UAAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C2'-exo, 8: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: syn, 6: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |