Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-4-Internal Loop pdb1ibmFA.n367-378 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1ibm:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
16S RIBOSOMAL RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | 3.31 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (362, 381), (367, 378) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GA_-_CAAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 9: O4'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||