Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'16-Hairpin pdb1ibm1A.e486-503 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1ibm:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.31 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (486, 503) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _CAACUCCGUGCCAGCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 5: C2'-endo, 11: C2'-endo, 12: C4'-exo, 13: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |