Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'1-6-Internal Loop pdb1gid1B.n29-90 | |||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1gid:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A GROUP I RIBOZYME DOMAIN: PRINCIPLES OF RNA PACKING | ||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | P4-P6 RNA RIBOZYME DOMAIN | ||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
Position | (32, 87), (34, 80) | ||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _U_-_AAUAAG_ | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
4: C3'-exo, 7: C2'-endo, 9: C4'-exo, 10: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
9: syn | ||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |