Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-4-Internal Loop pdb1gid1A.n25-93 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1gid:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF A GROUP I RIBOZYME DOMAIN: PRINCIPLES OF RNA PACKING | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | P4-P6 RNA RIBOZYME DOMAIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 2.50 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (19, 98), (25, 93) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AACAG_-_ACAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 4: C2'-endo, 5: C3'-exo, 11: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |