Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'3-2-Internal Loop pdb1g70FA.n1-32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1g70:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | COMPLEX OF HIV-1 RRE-IIB RNA WITH RSG-1.2 PEPTIDE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
HIV-1 RRE-IIB 32 NUCLEOTIDE RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (6, 27), (9, 23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUA_-_GG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 2: C4'-exo, 3: C4'-exo, 4: C2'-endo, 6: C4'-exo, 7: C4'-exo, 8: C2'-endo, 9: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 8: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |