Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-Segment pdb1fqz1A.i3-9 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1fqz:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | NMR VALIDATED MODEL OF DOMAIN IIID OF HEPATITIS C VIRUS INTERNAL RIBOSOME ENTRY SITE | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | HEPATITIS C VIRUS IRES DOMAIN IIID | ||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||
| Position | (3, 9) | ||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAGUA_ | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||
| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||
| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||
| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||