Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-6-Internal Loop pdb1fmnFA.n14-23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1fmn:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | SOLUTION STRUCTURE OF FMN-RNA APTAMER COMPLEX, NMR, 5 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
RNA (5'-R(*GP*GP*CP*GP*UP*GP*UP*AP*GP*GP FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (7, 29), (14, 23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GAAGG_-_AGGAUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C2'-exo, 2: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C4'-exo, 8: C2'-exo, 9: C4'-exo, 13: C4'-exo, 14: C4'-exo, 15: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |