Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '5-6-Internal Loop pdb1fka1A.n144-157 | |||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1fka:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF FUNCTIONALLY ACTIVATED SMALL RIBOSOMAL SUBUNIT AT 3.3 A RESOLUTION | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (138, 164), (144, 157) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _ACAAC_-_GCUAAU_ | ||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
13: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
11: unknown, 12: unknown, 13: unknown, 14: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||