Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '26-Hairpin pdb1fka1A.e1083-1110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1fka:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF FUNCTIONALLY ACTIVATED SMALL RIBOSOMAL SUBUNIT AT 3.3 A RESOLUTION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 16S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.30 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (1083, 1110) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
2: unknown, 3: unknown, 4: unknown, 5: unknown, 13: unknown, 14: unknown, 15: unknown, 16: unknown, 17: unknown, 23: unknown, 24: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||