Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '17-Segment pdb1ffz1A.i156-174 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1ffz:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH R(CC)-DA-PUROMYCIN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.20 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (156, 174) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GCCCUAUGGCUAUCUCA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C2'-endo, 7: C2'-endo, 8: C3'-exo, 16: C2'-endo, 19: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||