Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '11-Hairpin pdb1ffz1A.e139-151 | |||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1ffz:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT COMPLEXED WITH R(CC)-DA-PUROMYCIN | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | 23S RIBOSOMAL RNA | ||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | 3.20 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (139, 151) | ||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAAAAGAUAUC_ | ||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 9: C4'-exo, 12: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||
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Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||