Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-4-Internal Loop pdb1f841A.n2-28 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1f84:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | SOLUTION STRUCTURE OF HCV IRES RNA DOMAIN IIID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | HCV-1B IRES RNA DOMAIN IIID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 26), (10, 21) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GAGUA_-_GAAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C2'-endo, 4: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |