Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-1-Internal Loop pdb1f6uFB.n6-13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1f6u:B (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | NMR STRUCTURE OF THE HIV-1 NUCLEOCAPSID PROTEIN BOUND TO STEM-LOOP SL2 OF THE PSI-RNA PACKAGING SIGNAL. IMPLICATIONS FOR GENOME RECOGNITION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
HIV-1 STEM-LOOP SL2 FROM PSI-RNA PACKAGING FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 16), (6, 13) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UA_-_A_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: O4'-exo, 2: C2'-exo, 3: C4'-endo, 4: C4'-exo, 5: C2'-exo, 6: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |