Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'5-4-Internal Loop pdb1etfFA.n1-34 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1etf:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | REV RESPONSE ELEMENT (RRE) RNA COMPLEXED WITH REV PEPTIDE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
REV RESPONSE ELEMENT RNA FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 31), (9, 25) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUACA_-_UGGG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
5: C2'-endo, 6: C2'-endo, 8: C4'-exo, 9: C2'-endo, 10: C4'-exo, 11: C2'-endo, 12: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |