Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '2-1-Internal Loop pdb1esyFA.n1-19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1esy:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | NMR STRUCTURE OF STEM LOOP SL2 OF THE HIV-1 PSI RNA PACKAGING SIGNAL REVEALS A NOVEL A-U-A BASE-TRIPLE PLATFORM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
RNA (5'- FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (4, 16), (6, 13) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _UA_-_A_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-endo, 2: C1'-endo, 3: C4'-endo, 4: C2'-exo, 5: C4'-exo, 6: C4'-exo, 7: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||