Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'1-2-Internal Loop pdb1esy1A.n1-19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1esy:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | NMR STRUCTURE OF STEM LOOP SL2 OF THE HIV-1 PSI RNA PACKAGING SIGNAL REVEALS A NOVEL A-U-A BASE-TRIPLE PLATFORM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | RNA (5'- | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 16), (6, 13) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _A_-_UA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 2: C4'-exo, 3: C4'-exo, 4: C2'-exo, 5: C4'-endo, 6: C1'-endo, 7: C4'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |