Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '3-2-Internal Loop pdb1ebsFA.n1-29 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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| Source: [PDB-id:chain] | 1ebs:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | STRUCTURE OF RNA (5'-GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGCGGUACCAC-3'), NMR, 5 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound |
HIV-1 REV RESPONSIVE ELEMENT RNA FLIPPED INTERNAL |
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| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (4, 26), (7, 22) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GUA_-_GG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 2: O4'-endo, 3: C3'-exo, 4: C2'-endo, 8: C1'-exo, 9: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||