Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'3-2-Internal Loop pdb1ebrFA.n1-30 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1ebr:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF RNA (5'-GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGCGGUACCAC-3'), NMR, 5 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
HIV-1 REV RESPONSIVE ELEMENT RNA FLIPPED INTERNAL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 27), (7, 23) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GUA_-_GG_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 3: C2'-endo, 4: C3'-exo, 7: O4'-endo, 8: C3'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
4: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |