Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-3-Internal Loop pdb1ebq1A.n1-29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1ebq:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | STRUCTURE OF RNA (5'-GGUGGGCGCAGCUUCGGCUGCGGUACCAC-3'), NMR, 5 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | HIV-1 REV RESPONSIVE ELEMENT RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 26), (7, 22) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GG_-_GUA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
6: C2'-endo, 7: C3'-exo, 8: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |