Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'2-5-Internal Loop pdb1e7kFD.n9-15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1e7k:D (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | CRYSTAL STRUCTURE OF THE SPLICEOSOMAL 15.5KD PROTEIN BOUND TO A U4 SNRNA FRAGMENT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound |
RNA (5'- FLIPPED INTERNAL |
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Source: Resolution | 2.90 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (3, 18), (9, 15) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GA_-_AAUGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-endo, 3: O4'-endo, 5: C2'-endo, 6: C4'-exo, 7: C2'-endo, 8: C2'-endo, 9: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
9: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |