Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'10-Hairpin pdb1ddy1A.e9-20 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1ddy:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | MOLECULAR RECOGNITION BY THE VITAMIN B12 RNA APTAMER | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | VITAMIN B12 BINDING RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 3.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (9, 20) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GCGCAUAACC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
3: C4'-exo, 6: C2'-endo, 7: C1'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
7: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |