Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'8-Segment pdb1c041E.i31-40 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1c04:E (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
Source: Information | IDENTIFICATION OF KNOWN PROTEIN AND RNA STRUCTURES IN A 5 A MAP OF THE LARGE RIBOSOMAL SUBUNIT FROM HALOARCULA MARISMORTUI | ||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | 23S RRNA FRAGMENT | ||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | 5.00 ANGSTROMS. | ||||||||||||||||||||||||
Position | (31, 40) | ||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UUAAAGAA_ | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 3: C2'-exo, 8: C3'-exo, 9: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn, 8: syn | ||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
![]() |
|||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |