Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-Hairpin pdb1bn01A.e8-13 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Source: [PDB-id:chain] | 1bn0:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||
Source: Information | SL3 HAIRPIN FROM THE PACKAGING SIGNAL OF HIV-1, NMR, 11 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | SL3 RNA HAIRPIN | ||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||
Position | (8, 13) | ||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _GGAG_ | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 3: C2'-endo, 4: O4'-endo, 5: C2'-exo, 6: C1'-endo | ||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 4: syn | ||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases | None | ||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
|
||||||||||||||||||||||||
Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
||||||||||||||||||||||||
3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |