Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '7-Hairpin pdb1bj21A.e7-15 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1bj2:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||
| Source: Information | RNA LOOP-LOOP COMPLEX: THE COLE1 INVERTED LOOP SEQUENCE, NMR, 8 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||
| Source: Compound | RNA (5'- | ||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||
| Position | (7, 15) | ||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _GAUGGUU_ | ||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 3: C4'-exo, 7: C4'-exo, 8: C4'-exo | ||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases |
|
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|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||