Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'7-9-Internal Loop pdb1b361A.n1-38 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1b36:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | SOLUTION STRUCTURE OF THE HAIRPIN RIBOZYME LOOP B DOMAIN RNA, NMR, 10 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | RNA (RNA LOOP B) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (5, 34), (13, 24) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _AGAAACA_-_GUAUAUUAC_ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C4'-exo, 5: C2'-exo, 6: C2'-exo, 8: C4'-exo, 10: C4'-exo, 12: O4'-endo, 15: C2'-endo, 16: C2'-endo, 18: C4'-exo, 20: C4'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
|
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |