Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
| '6-Hairpin pdb1arj1N.e13-20 | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Source: [PDB-id:chain] | 1arj:N (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Information | ARG-BOUND TAR RNA, NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Compound | TAR RNA | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Position | (13, 20) | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Primary structure ('_': anchors) | _CUGGGA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
2: C2'-exo, 4: C2'-exo, 5: C2'-exo, 6: C2'-exo, 7: C2'-exo | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
6: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Tertiary structure: Stacked bases | None | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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| Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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| 3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
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| Structural Clusters | |||||||||||||||||||||||||||||||