Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
'4-Hairpin pdb1afx1A.e4-9 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Source: [PDB-id:chain] | 1afx:A (&rarr PDB) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Information | UGAA EUKARYOTIC RIBOSOMAL RNA TETRALOOP, NMR, 13 STRUCTURES | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Compound | RNA (5'-R(*GP*GP*UP*GP*UP*GP*AP*AP*CP*AP*CP*C)- | ||||||||||||||||||||||||||||||
Source: Resolution | NOT APPLICABLE. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Position | (4, 9) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Primary structure ('_': anchors) | _UGAA_ | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual sugar puckers (Standard: C3'-endo) |
1: C4'-exo, 3: C4'-exo, 4: C3'-exo, 5: C2'-endo | ||||||||||||||||||||||||||||||
Bases with unusual glycosidic-bond configuration (Standard: anti) |
3: syn, 4: syn, 5: syn | ||||||||||||||||||||||||||||||
Tertiary structure: Stacked bases |
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Tertiary structure: Base-pairs (anchor pairs) |
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Downloads |
Atom coordinates (PDB format) Contact annotation (MC-Annotate format) |
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3D Structure | Structure Graph | ||||||||||||||||||||||||||||||
Structural Clusters |