Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(016)-Hairpin cluster 91 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 78 structure(s)
Representative structure 2vqf:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence YAACUCYGUGCCAGCA
Cluster members
CAACUCCGUGCCAGCA
1fjg:A, 486-503, 1hnw:A, 486-503, 1hnx:A, 486-503, 1hnz:A, 486-503, 1hr0:A, 486-503, 1i94:A, 489-506, 1i95:A, 489-506, 1i96:A, 489-506, 1i97:A, 489-506, 1ibk:A, 486-503, 1ibl:A, 486-503, 1ibm:A, 486-503, 1j5e:A, 486-503, 1n32:A, 486-503, 1n33:A, 486-503, 1n34:A, 486-503, 1n36:A, 486-503, 1pns:A, 500-517, 1pnx:A, 500-517, 1s1h:A, 491-508, 1voq:A, 500-517, 1vos:A, 500-517, 1vov:A, 500-517, 1vox:A, 500-517, 1voz:A, 500-517, 1xmo:A, 486-503, 1xmq:A, 486-503, 1xnq:A, 486-503, 1xnr:A, 486-503, 2e5l:A, 487-504, 2f4v:A, 486-503, 2hgp:A, 486-503, 2hhh:A, 486-503, 2j00:A, 486-503, 2j02:A, 486-503, 2jl5:A, 486-503, 2jl7:A, 486-503, 2noq:B, 8-25, 2ow8:y, 486-503, 2qnh:y, 486-503, 2uu9:A, 486-503, 2uua:A, 486-503, 2uub:A, 486-503, 2uuc:A, 486-503, 2uxb:A, 486-503, 2uxc:A, 486-503, 2uxd:A, 464-481, 2v46:A, 486-503, 2v48:A, 486-503, 2vqe:A, 486-503, 2vqf:A, 486-503, 3d5a:A, 486-503, 3d5c:A, 486-503
UAACUCCGUGCCAGCA
1vs5:A, 503-520, 1vs7:A, 503-520, 2avy:A, 503-520, 2aw7:A, 503-520, 2gyb:A, 473-490, 2i2p:A, 503-520, 2i2u:A, 503-520, 2qal:A, 503-520, 2qan:A, 503-520, 2qb9:A, 503-520, 2qbb:A, 503-520, 2qbd:A, 503-520, 2qbf:A, 503-520, 2qbh:A, 503-520, 2qbj:A, 503-520, 2qou:A, 503-520, 2qow:A, 503-520, 2qoy:A, 503-520, 2qp0:A, 503-520, 2vhp:A, 503-520, 2z4k:A, 503-520, 2z4m:A, 503-520, 3df1:A, 503-520, 3df3:A, 503-520
UAACUCUGUGCCAGCA
3bbn:A, 450-467