Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(013)-Hairpin cluster 279 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 117 structure(s)
Representative structure 3ccu:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence UGAAKGCAUCUAA
Cluster members
UGAAAGCAUCUAA
1j5a:A, 2646-2660, 1jzx:A, 2646-2660, 1jzy:A, 2646-2660, 1jzz:A, 2646-2660, 1k01:A, 2646-2660, 1njm:0, 2638-2652, 1njn:0, 2638-2652, 1njo:0, 2638-2652, 1njp:0, 2638-2652, 1nkw:0, 2638-2652, 1nwx:0, 2638-2652, 1nwy:0, 2638-2652, 1ond:0, 2637-2651, 1pnu:0, 2682-2696, 1pny:0, 2682-2696, 1sm1:0, 2638-2652, 1vs6:B, 2692-2706, 1vs8:B, 2692-2706, 1y69:0, 2638-2652, 1yl3:A, 2722-2736, 2aar:0, 2638-2652, 2aw4:B, 2692-2706, 2awb:B, 2692-2706, 2d3o:0, 2659-2673, 2gya:0, 2601-2615, 2gyc:0, 2601-2615, 2i2t:B, 2692-2706, 2i2v:B, 2692-2706, 2j01:A, 2624-2638, 2j03:A, 2624-2638, 2j28:B, 2692-2706, 2jl6:A, 2703-2717, 2jl8:A, 2703-2717, 2o43:A, 2638-2652, 2ogm:0, 2638-2652, 2ogn:0, 2638-2652, 2ogo:0, 2637-2651, 2qam:B, 2692-2706, 2qao:B, 2692-2706, 2qba:B, 2692-2706, 2qbe:B, 2692-2706, 2qbg:B, 2692-2706, 2qbi:B, 2692-2706, 2qbk:B, 2692-2706, 2qoz:B, 2692-2706, 2v47:A, 2619-2633, 2v49:A, 2619-2633, 2z4l:B, 2692-2706, 2zjp:X, 2549-2563, 2zjr:X, 2546-2560, 3bbx:B, 2975-2989, 3cf5:X, 2549-2563, 3d5b:A, 2731-2745, 3d5d:A, 2731-2745, 3df2:B, 2692-2706, 3df4:B, 2692-2706, 3dll:X, 2549-2563
UGAACGCAUCUAA
1ffk:0, 2593-2607, 1jj2:0, 2644-2658, 1k73:A, 2644-2658, 1k8a:A, 2644-2658, 1k9m:A, 2644-2658, 1kc8:A, 2644-2658, 1kd1:A, 2644-2658, 1kqs:0, 2644-2658, 1m1k:A, 2644-2658, 1m90:A, 2644-2658, 1n8r:A, 2644-2658, 1nji:A, 2644-2658, 1q7y:A, 2644-2658, 1q81:A, 2644-2658, 1q82:A, 2644-2658, 1q86:A, 2644-2658, 1qvf:0, 2644-2658, 1qvg:0, 2644-2658, 1s1i:3, 2960-2974, 1s72:0, 2644-2658, 1vq4:0, 2644-2658, 1vq5:0, 2644-2658, 1vq6:0, 2644-2658, 1vq7:0, 2644-2658, 1vq8:0, 2644-2658, 1vq9:0, 2644-2658, 1vqk:0, 2644-2658, 1vql:0, 2644-2658, 1vqm:0, 2644-2658, 1vqn:0, 2644-2658, 1vqo:0, 2644-2658, 1vqp:0, 2644-2658, 1w2b:0, 2644-2658, 1yhq:0, 2644-2658, 1yi2:0, 2644-2658, 1yij:0, 2644-2658, 1yit:0, 2644-2658, 1yj9:0, 2644-2658, 1yjn:0, 2644-2658, 1yjw:0, 2644-2658, 2otj:0, 2644-2658, 2otl:0, 2644-2658, 2qa4:0, 2649-2663, 2qex:0, 2644-2658, 3cc2:0, 2644-2658, 3cc4:0, 2644-2658, 3cc7:0, 2644-2658, 3cce:0, 2644-2658, 3ccj:0, 2644-2658, 3ccl:0, 2644-2658, 3ccm:0, 2644-2658, 3ccq:0, 2644-2658, 3ccr:0, 2644-2658, 3ccs:0, 2644-2658, 3ccu:0, 2644-2658, 3ccv:0, 2644-2658, 3cd6:0, 2644-2658, 3cma:0, 2644-2658, 3cme:0, 2644-2658, 3cpw:0, 2644-2658