Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(009)-Hairpin cluster 45 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 65 structure(s)
Representative structure 1hnz:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence UUGAUCKUG
Cluster members
UUGAUCAUG
1vs5:A, 8-18, 1vs7:A, 8-18, 2avy:A, 8-18, 2aw7:A, 8-18, 2gy9:A, 8-18, 2gyb:A, 8-18, 2i2p:A, 8-18, 2i2u:A, 8-18, 2qal:A, 8-18, 2qan:A, 8-18, 2qb9:A, 8-18, 2qbb:A, 8-18, 2qbd:A, 8-18, 2qbf:A, 8-18, 2qbh:A, 8-18, 2qbj:A, 8-18, 2qou:A, 8-18, 2qow:A, 8-18, 2qoy:A, 8-18, 2qp0:A, 8-18, 2z4k:A, 8-18, 2z4m:A, 8-18, 3df1:A, 8-18, 3df3:A, 8-18
UUGAUCCUG
1fjg:A, 8-18, 1hnw:A, 8-18, 1hnx:A, 8-18, 1hnz:A, 8-18, 1hr0:A, 8-18, 1i94:A, 11-21, 1i95:A, 11-21, 1i96:A, 11-21, 1i97:A, 11-21, 1ibk:A, 8-18, 1ibl:A, 8-18, 1ibm:A, 8-18, 1j5e:A, 8-18, 1n32:A, 8-18, 1n33:A, 8-18, 1n36:A, 8-18, 1pns:A, 8-18, 1pnx:A, 8-18, 1s1h:A, 8-18, 1xmo:A, 8-18, 1xmq:A, 8-18, 1xnq:A, 8-18, 1xnr:A, 8-18, 2e5l:A, 9-19, 2f4v:A, 8-18, 2hhh:A, 8-18, 2j00:A, 8-18, 2j02:A, 8-18, 2jl5:A, 8-18, 2jl7:A, 8-18, 2uu9:A, 8-18, 2uua:A, 8-18, 2uub:A, 8-18, 2uuc:A, 8-18, 2uxb:A, 8-18, 2uxc:A, 8-18, 2uxd:A, 8-18, 2vqe:A, 8-18, 2vqf:A, 8-18, 3d5a:A, 8-18, 3d5c:A, 8-18