Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(008)-Hairpin cluster 492 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 137 structure(s)
Representative structure 1yhq:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence UBAAMAUU
Cluster members
UCAAGAUU
1j5a:A, 1344-1353, 1jzx:A, 1344-1353, 1jzy:A, 1344-1353, 1jzz:A, 1344-1353, 1k01:A, 1344-1353, 1njm:0, 1336-1345, 1njn:0, 1336-1345, 1njo:0, 1336-1345, 1njp:0, 1336-1345, 1nkw:0, 1336-1345, 1nwx:0, 1336-1345, 1nwy:0, 1336-1345, 1ond:0, 1336-1345, 1pnu:0, 1352-1361, 1pny:0, 1352-1361, 1xbp:0, 1336-1345, 1y69:0, 1336-1345, 2aar:0, 1336-1345, 2d3o:0, 1336-1345, 2o43:A, 1336-1345, 2o45:A, 1333-1342, 2ogm:0, 1336-1345, 2ogn:0, 1336-1345, 2ogo:0, 1335-1344, 2zjp:X, 1314-1323, 2zjq:X, 1314-1323, 2zjr:X, 1311-1320, 3cf5:X, 1314-1323, 3dll:X, 1314-1323
UGAAUAUU
3bbo:A, 1355-1364
UUAAUAUU
1ffk:0, 1420-1429, 1jj2:0, 1467-1476, 1k73:A, 1467-1476, 1k8a:A, 1467-1476, 1k9m:A, 1467-1476, 1kc8:A, 1467-1476, 1kd1:A, 1467-1476, 1kqs:0, 1467-1476, 1m1k:A, 1467-1476, 1m90:A, 1467-1476, 1n8r:A, 1467-1476, 1nji:A, 1467-1476, 1q7y:A, 1467-1476, 1q81:A, 1467-1476, 1q82:A, 1467-1476, 1q86:A, 1467-1476, 1qvf:0, 1467-1476, 1qvg:0, 1467-1476, 1s1i:3, 1578-1587, 1s72:0, 1467-1476, 1vq4:0, 1467-1476, 1vq5:0, 1467-1476, 1vq6:0, 1467-1476, 1vq7:0, 1467-1476, 1vq8:0, 1467-1476, 1vq9:0, 1467-1476, 1vqk:0, 1467-1476, 1vql:0, 1467-1476, 1vqm:0, 1467-1476, 1vqn:0, 1467-1476, 1vqo:0, 1467-1476, 1vqp:0, 1467-1476, 1vs6:B, 1373-1382, 1vs8:B, 1373-1382, 1vsp:w, 1414-1423, 1w2b:0, 1467-1476, 1yhq:0, 1467-1476, 1yi2:0, 1467-1476, 1yij:0, 1467-1476, 1yit:0, 1467-1476, 1yj9:0, 1467-1476, 1yjn:0, 1467-1476, 1yjw:0, 1467-1476, 1yl3:A, 1413-1422, 2aw4:B, 1373-1382, 2awb:B, 1373-1382, 2b66:A, 1413-1422, 2b9n:A, 1413-1422, 2b9p:A, 1413-1422, 2gya:0, 1312-1321, 2gyc:0, 1312-1321, 2hgj:A, 1413-1422, 2hgq:A, 1413-1422, 2hgu:A, 1413-1422, 2i2t:B, 1373-1382, 2i2v:B, 1373-1382, 2j01:A, 1339-1348, 2j03:A, 1339-1348, 2j28:B, 1373-1382, 2j37:Z, 165-174, 2jl6:A, 1418-1427, 2jl8:A, 1418-1427, 2otj:0, 1467-1476, 2otl:0, 1467-1476, 2qa4:0, 1472-1481, 2qam:B, 1373-1382, 2qao:B, 1373-1382, 2qba:B, 1373-1382, 2qbc:B, 1373-1382, 2qbe:B, 1373-1382, 2qbg:B, 1373-1382, 2qbi:B, 1373-1382, 2qbk:B, 1373-1382, 2qex:0, 1467-1476, 2qov:B, 1373-1382, 2qox:B, 1373-1382, 2qoz:B, 1373-1382, 2qp1:B, 1373-1382, 2v47:A, 1339-1348, 2v49:A, 1339-1348, 2vhm:B, 1373-1382, 2vhn:B, 1373-1382, 2z4l:B, 1373-1382, 2z4n:B, 1373-1382, 3bbx:B, 1454-1463, 3bo0:F, 5-14, 3bo1:F, 5-14, 3cc2:0, 1467-1476, 3cc4:0, 1467-1476, 3cc7:0, 1467-1476, 3cce:0, 1467-1476, 3ccj:0, 1467-1476, 3ccl:0, 1467-1476, 3ccm:0, 1467-1476, 3ccq:0, 1467-1476, 3ccr:0, 1467-1476, 3ccs:0, 1467-1476, 3ccu:0, 1467-1476, 3ccv:0, 1467-1476, 3cd6:0, 1467-1476, 3cma:0, 1467-1476, 3cme:0, 1467-1476, 3cpw:0, 1467-1476, 3d5b:A, 1409-1418, 3d5d:A, 1409-1418, 3df2:B, 1373-1382, 3df4:B, 1373-1382