Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(007)-Hairpin cluster 474 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 130 structure(s)
Representative structure 1qvf:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence UGGGGCG
Cluster members
UGGGGCG
1ffk:0, 2096-2104, 1j5a:A, 2148-2156, 1jj2:0, 2146-2154, 1jzx:A, 2148-2156, 1jzy:A, 2148-2156, 1jzz:A, 2148-2156, 1k01:A, 2148-2156, 1k73:A, 2146-2154, 1k8a:A, 2146-2154, 1k9m:A, 2146-2154, 1kc8:A, 2146-2154, 1kd1:A, 2146-2154, 1kqs:0, 2146-2154, 1m1k:A, 2146-2154, 1m90:A, 2146-2154, 1n8r:A, 2146-2154, 1nji:A, 2146-2154, 1njm:0, 2140-2148, 1njn:0, 2140-2148, 1njo:0, 2140-2148, 1njp:0, 2140-2148, 1nkw:0, 2140-2148, 1nwx:0, 2140-2148, 1nwy:0, 2140-2148, 1ond:0, 2139-2147, 1p9x:0, 2115-2123, 1pnu:0, 2184-2192, 1pny:0, 2184-2192, 1q7y:A, 2146-2154, 1q81:A, 2146-2154, 1q82:A, 2146-2154, 1q86:A, 2146-2154, 1qvf:0, 2146-2154, 1qvg:0, 2146-2154, 1s1i:3, 2446-2454, 1s72:0, 2146-2154, 1sm1:0, 2140-2148, 1vq4:0, 2146-2154, 1vq5:0, 2146-2154, 1vq6:0, 2146-2154, 1vq7:0, 2146-2154, 1vq8:0, 2146-2154, 1vq9:0, 2146-2154, 1vqk:0, 2146-2154, 1vql:0, 2146-2154, 1vqm:0, 2146-2154, 1vqn:0, 2146-2154, 1vqo:0, 2146-2154, 1vqp:0, 2146-2154, 1vs6:B, 2195-2203, 1vs8:B, 2195-2203, 1vsa:w, 2238-2246, 1vsp:w, 2238-2246, 1w2b:0, 2146-2154, 1xbp:0, 2140-2148, 1y69:0, 2140-2148, 1yhq:0, 2146-2154, 1yi2:0, 2146-2154, 1yij:0, 2146-2154, 1yit:0, 2146-2154, 1yj9:0, 2146-2154, 1yjn:0, 2146-2154, 1yjw:0, 2146-2154, 1z58:2, 2119-2127, 2aar:0, 2140-2148, 2aw4:B, 2195-2203, 2awb:B, 2195-2203, 2d3o:0, 2161-2169, 2gya:0, 2119-2127, 2gyc:0, 2119-2127, 2i2t:B, 2195-2203, 2i2v:B, 2195-2203, 2j01:A, 2126-2134, 2j03:A, 2126-2134, 2j28:B, 2195-2203, 2jl6:A, 2205-2213, 2jl8:A, 2205-2213, 2o43:A, 2140-2148, 2o44:A, 2140-2148, 2o45:A, 2128-2136, 2ogm:0, 2140-2148, 2ogn:0, 2140-2148, 2ogo:0, 2139-2147, 2otj:0, 2146-2154, 2otl:0, 2146-2154, 2qa4:0, 2151-2159, 2qam:B, 2195-2203, 2qao:B, 2195-2203, 2qba:B, 2195-2203, 2qbc:B, 2195-2203, 2qbe:B, 2195-2203, 2qbg:B, 2195-2203, 2qbi:B, 2195-2203, 2qbk:B, 2195-2203, 2qex:0, 2146-2154, 2qov:B, 2195-2203, 2qox:B, 2195-2203, 2qoz:B, 2195-2203, 2qp1:B, 2195-2203, 2v47:A, 2121-2129, 2v49:A, 2121-2129, 2vhm:B, 2195-2203, 2vhn:B, 2195-2203, 2z4l:B, 2195-2203, 2z4n:B, 2195-2203, 2zjp:X, 2051-2059, 2zjq:X, 2051-2059, 2zjr:X, 2048-2056, 3bbx:B, 2472-2480, 3cc2:0, 2146-2154, 3cc4:0, 2146-2154, 3cc7:0, 2146-2154, 3ccj:0, 2146-2154, 3ccl:0, 2146-2154, 3ccm:0, 2146-2154, 3ccq:0, 2146-2154, 3ccr:0, 2146-2154, 3ccs:0, 2146-2154, 3ccu:0, 2146-2154, 3ccv:0, 2146-2154, 3cd6:0, 2146-2154, 3cf5:X, 2051-2059, 3cma:0, 2146-2154, 3cme:0, 2146-2154, 3cpw:0, 2146-2154, 3d5b:A, 2233-2241, 3d5d:A, 2233-2241, 3df2:B, 2195-2203, 3df4:B, 2195-2203, 3dll:X, 2051-2059