Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(007)-Hairpin cluster 428 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 123 structure(s)
Representative structure 1q81:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence SMYRWRK
Cluster members
CUCAUAC
1ffk:0, 1196-1204, 1jj2:0, 1243-1251, 1k73:A, 1243-1251, 1k8a:A, 1243-1251, 1k9m:A, 1243-1251, 1kc8:A, 1243-1251, 1kd1:A, 1243-1251, 1kqs:0, 1243-1251, 1m1k:A, 1243-1251, 1m90:A, 1243-1251, 1n8r:A, 1243-1251, 1nji:A, 1243-1251, 1pns:A, 456-464, 1pnx:A, 456-464, 1q7y:A, 1243-1251, 1q81:A, 1243-1251, 1q82:A, 1243-1251, 1q86:A, 1243-1251, 1qvf:0, 1243-1251, 1qvg:0, 1243-1251, 1s1i:3, 1348-1356, 1s72:0, 1243-1251, 1vq4:0, 1243-1251, 1vq5:0, 1243-1251, 1vq6:0, 1243-1251, 1vq7:0, 1243-1251, 1vq8:0, 1243-1251, 1vq9:0, 1243-1251, 1vqk:0, 1243-1251, 1vql:0, 1243-1251, 1vqm:0, 1243-1251, 1vqn:0, 1243-1251, 1vqo:0, 1243-1251, 1vqp:0, 1243-1251, 1w2b:0, 1243-1251, 1yhq:0, 1243-1251, 1yi2:0, 1243-1251, 1yij:0, 1243-1251, 1yit:0, 1243-1251, 1yj9:0, 1243-1251, 1yjn:0, 1243-1251, 1yjw:0, 1243-1251, 2otj:0, 1243-1251, 2otl:0, 1243-1251, 2qa4:0, 1248-1256, 2qex:0, 1243-1251, 3cc2:0, 1243-1251, 3cc4:0, 1243-1251, 3cc7:0, 1243-1251, 3cce:0, 1243-1251, 3ccj:0, 1243-1251, 3ccl:0, 1243-1251, 3ccm:0, 1243-1251, 3ccq:0, 1243-1251, 3ccr:0, 1243-1251, 3ccs:0, 1243-1251, 3ccu:0, 1243-1251, 3ccv:0, 1243-1251, 3cd6:0, 1243-1251, 3cma:0, 1243-1251, 3cme:0, 1243-1251, 3cpw:0, 1243-1251
GGCGAAA
1ffk:0, 1626-1634, 1jj2:0, 1676-1684, 1k73:A, 1676-1684, 1k8a:A, 1676-1684, 1k9m:A, 1676-1684, 1kc8:A, 1676-1684, 1kd1:A, 1676-1684, 1kqs:0, 1676-1684, 1m1k:A, 1676-1684, 1m90:A, 1676-1684, 1n8r:A, 1676-1684, 1nji:A, 1676-1684, 1q7y:A, 1676-1684, 1q81:A, 1676-1684, 1q82:A, 1676-1684, 1q86:A, 1676-1684, 1qvf:0, 1676-1684, 1qvg:0, 1676-1684, 1s1i:3, 1784-1792, 1s72:0, 1676-1684, 1vq4:0, 1676-1684, 1vq5:0, 1676-1684, 1vq6:0, 1676-1684, 1vq7:0, 1676-1684, 1vq8:0, 1676-1684, 1vq9:0, 1676-1684, 1vqk:0, 1676-1684, 1vql:0, 1676-1684, 1vqm:0, 1676-1684, 1vqn:0, 1676-1684, 1vqo:0, 1676-1684, 1vqp:0, 1676-1684, 1w2b:0, 1676-1684, 1yhq:0, 1676-1684, 1yi2:0, 1676-1684, 1yij:0, 1676-1684, 1yit:0, 1676-1684, 1yj9:0, 1676-1684, 1yjn:0, 1676-1684, 1yjw:0, 1676-1684, 2otj:0, 1676-1684, 2otl:0, 1676-1684, 2qa4:0, 1681-1689, 2qex:0, 1676-1684, 3cc2:0, 1676-1684, 3cc4:0, 1676-1684, 3cc7:0, 1676-1684, 3cce:0, 1676-1684, 3ccj:0, 1676-1684, 3ccl:0, 1676-1684, 3ccm:0, 1676-1684, 3ccq:0, 1676-1684, 3ccr:0, 1676-1684, 3ccs:0, 1676-1684, 3ccu:0, 1676-1684, 3ccv:0, 1676-1684, 3cd6:0, 1676-1684, 3cma:0, 1676-1684, 3cme:0, 1676-1684, 3cpw:0, 1676-1684
GUUAUGC
2gya:0, 1096-1104