Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(007)-Hairpin cluster 204 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 126 structure(s)
Representative structure 1k9m:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GYHCAYA
Cluster members
GCACAUA
1ffk:0, 2319-2327, 1ffz:A, 345-353, 1fg0:A, 345-353, 1jj2:0, 2369-2377, 1k73:A, 2369-2377, 1k8a:A, 2369-2377, 1k9m:A, 2369-2377, 1kc8:A, 2369-2377, 1kd1:A, 2369-2377, 1kqs:0, 2369-2377, 1m1k:A, 2369-2377, 1m90:A, 2369-2377, 1n8r:A, 2369-2377, 1nji:A, 2369-2377, 1q7y:A, 2369-2377, 1q81:A, 2369-2377, 1q82:A, 2369-2377, 1q86:A, 2369-2377, 1qvf:0, 2369-2377, 1qvg:0, 2369-2377, 1s1i:3, 2686-2694, 1s72:0, 2369-2377, 1vq4:0, 2369-2377, 1vq5:0, 2369-2377, 1vq6:0, 2369-2377, 1vq7:0, 2369-2377, 1vq8:0, 2369-2377, 1vq9:0, 2369-2377, 1vqk:0, 2369-2377, 1vql:0, 2369-2377, 1vqm:0, 2369-2377, 1vqn:0, 2369-2377, 1vqo:0, 2369-2377, 1vqp:0, 2369-2377, 1w2b:0, 2369-2377, 1yhq:0, 2369-2377, 1yi2:0, 2369-2377, 1yij:0, 2369-2377, 1yit:0, 2369-2377, 1yj9:0, 2369-2377, 1yjn:0, 2369-2377, 1yjw:0, 2369-2377, 2otj:0, 2369-2377, 2otl:0, 2369-2377, 2qa4:0, 2374-2382, 2qex:0, 2369-2377, 3cc2:0, 2369-2377, 3cc4:0, 2369-2377, 3cc7:0, 2369-2377, 3cce:0, 2369-2377, 3ccj:0, 2369-2377, 3ccl:0, 2369-2377, 3ccm:0, 2369-2377, 3ccq:0, 2369-2377, 3ccr:0, 2369-2377, 3ccs:0, 2369-2377, 3ccu:0, 2369-2377, 3ccv:0, 2369-2377, 3cd6:0, 2369-2377, 3cma:0, 2369-2377, 3cme:0, 2369-2377, 3cpw:0, 2369-2377
GUCCACA
2b66:A, 2389-2397, 2b9n:A, 2389-2397, 2b9p:A, 2389-2397, 2hgj:A, 2461-2469, 2hgq:A, 2461-2469, 2hgu:A, 2461-2469, 2jl6:A, 2428-2436, 2jl8:A, 2428-2436, 2v47:A, 2344-2352, 2v49:A, 2344-2352, 3d5b:A, 2456-2464, 3d5d:A, 2456-2464
GUCCAUA
1j5a:A, 2371-2379, 1njm:0, 2363-2371, 1njn:0, 2363-2371, 1njo:0, 2363-2371, 1njp:0, 2363-2371, 1nkw:0, 2363-2371, 1nwx:0, 2363-2371, 1nwy:0, 2363-2371, 1ond:0, 2362-2370, 1pnu:0, 2407-2415, 1pny:0, 2407-2415, 1sm1:0, 2363-2371, 1y69:0, 2363-2371, 2aar:0, 2363-2371, 2d3o:0, 2384-2392, 2o43:A, 2363-2371, 2o45:A, 2351-2359, 2ogm:0, 2363-2371, 2ogn:0, 2363-2371, 2ogo:0, 2362-2370, 2zjp:X, 2274-2282, 2zjq:X, 2274-2282, 2zjr:X, 2271-2279, 3cf5:X, 2274-2282, 3dll:X, 2274-2282
GUUCAUA
1vs6:B, 2418-2426, 1vs8:B, 2418-2426, 2aw4:B, 2418-2426, 2awb:B, 2418-2426, 2gya:0, 2333-2341, 2i2t:B, 2418-2426, 2i2v:B, 2418-2426, 2j28:B, 2418-2426, 2qam:B, 2418-2426, 2qao:B, 2418-2426, 2qba:B, 2418-2426, 2qbc:B, 2418-2426, 2qbe:B, 2418-2426, 2qbg:B, 2418-2426, 2qbi:B, 2418-2426, 2qbk:B, 2418-2426, 2qov:B, 2418-2426, 2qox:B, 2418-2426, 2qoz:B, 2418-2426, 2qp1:B, 2418-2426, 2vhm:B, 2418-2426, 2vhn:B, 2418-2426, 2z4l:B, 2418-2426, 2z4n:B, 2418-2426, 3bbx:B, 2701-2709, 3df2:B, 2418-2426, 3df4:B, 2418-2426