Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(004)-Hairpin cluster 484 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 141 structure(s)
Representative structure 1kqs:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GHVR
Cluster members
GAAA
1ffk:0, 794-799, 1hnw:A, 148-153, 1hnx:A, 148-153, 1hnz:A, 148-153, 1ibl:A, 148-153, 1ibm:A, 148-153, 1jj2:0, 798-803, 1k73:A, 798-803, 1k8a:A, 798-803, 1k9m:A, 798-803, 1kc8:A, 798-803, 1kd1:A, 798-803, 1kqs:0, 798-803, 1m1k:A, 798-803, 1m5k:E, 74-79, 1m90:A, 798-803, 1n8r:A, 798-803, 1nji:A, 798-803, 1q7y:A, 798-803, 1q81:A, 798-803, 1q82:A, 798-803, 1qvf:0, 798-803, 1qvg:0, 798-803, 1s1i:3, 797-802, 1s72:0, 798-803, 1x8w:B, 54-59, 1xmq:A, 148-153, 1xnq:A, 148-153, 1xnr:A, 148-153, 1y0q:A, 184-189, 1ysh:A, 13-18, 2gy9:A, 147-152, 2gya:0, 1704-1709, 2jl7:A, 148-153, 2qa4:0, 797-802, 2qex:0, 798-803, 2uu9:A, 148-153, 2uub:A, 148-153, 2uxd:A, 144-149, 2vqf:A, 148-153, 3cce:0, 798-803, 3cme:0, 798-803, 3cpw:0, 798-803
GACG
2qbc:B, 2303-2308, 2z4l:B, 2303-2308, 2z4n:B, 2303-2308
GCAA
1ffk:0, 1783-1788, 1i94:A, 873-878, 1jj2:0, 1833-1838, 1k73:A, 1833-1838, 1k8a:A, 1833-1838, 1k9m:A, 1833-1838, 1kc8:A, 1833-1838, 1kd1:A, 1833-1838, 1kqs:0, 1833-1838, 1m1k:A, 1833-1838, 1m90:A, 1833-1838, 1n36:A, 870-875, 1n8r:A, 1833-1838, 1nji:A, 1833-1838, 1pns:A, 181-186, 1pnx:A, 181-186, 1q7y:A, 1833-1838, 1q81:A, 1833-1838, 1q82:A, 1833-1838, 1q86:A, 1833-1838, 1qvf:0, 1833-1838, 1qvg:0, 1833-1838, 1s1i:3, 1941-1946, 1s72:0, 1833-1838, 1vq4:0, 1833-1838, 1vq5:0, 1833-1838, 1vq6:0, 1833-1838, 1vq7:0, 1833-1838, 1vq8:0, 1833-1838, 1vq9:0, 1833-1838, 1vqk:0, 1833-1838, 1vql:0, 1833-1838, 1vqm:0, 1833-1838, 1vqn:0, 1833-1838, 1vqo:0, 1833-1838, 1vqp:0, 1833-1838, 1vs5:A, 893-898, 1w2b:0, 1833-1838, 1yhq:0, 1833-1838, 1yi2:0, 1833-1838, 1yij:0, 1833-1838, 1yit:0, 1833-1838, 1yj9:0, 1833-1838, 1yjn:0, 1833-1838, 1yjw:0, 1833-1838, 1yl4:A, 870-875, 2avy:A, 893-898, 2aw7:A, 893-898, 2b64:A, 870-875, 2b9m:A, 870-875, 2b9o:A, 870-875, 2e5l:A, 871-876, 2hgi:A, 870-875, 2hgp:A, 870-875, 2hgr:A, 870-875, 2hhh:A, 870-875, 2otj:0, 1833-1838, 2otl:0, 1833-1838, 2qa4:0, 1838-1843, 2qan:A, 893-898, 2qb9:A, 893-898, 2qbb:A, 893-898, 2qbh:A, 893-898, 2qbj:A, 893-898, 2qex:0, 1833-1838, 2qou:A, 893-898, 2qow:A, 893-898, 2qoy:A, 893-898, 2qp0:A, 893-898, 2v46:A, 870-875, 2v48:A, 870-875, 2z4k:A, 893-898, 2z4m:A, 893-898, 3cc2:0, 1833-1838, 3cc4:0, 1833-1838, 3cc7:0, 1833-1838, 3cce:0, 1833-1838, 3ccj:0, 1833-1838, 3ccl:0, 1833-1838, 3ccm:0, 1833-1838, 3ccq:0, 1833-1838, 3ccr:0, 1833-1838, 3ccs:0, 1833-1838, 3ccu:0, 1833-1838, 3ccv:0, 1833-1838, 3cd6:0, 1833-1838, 3cma:0, 1833-1838, 3cme:0, 1833-1838, 3cpw:0, 1833-1838, 3df1:A, 893-898, 3df3:A, 893-898
GCGA
3d5b:B, 86-91, 3d5d:B, 86-91
GUAA
301d:B, 11-16
GUGA
1sm1:0, 2486-2491