Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(9-9)-Internal loop cluster 171 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 116 structure(s)
Representative structure 1yi2:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence CAGUAAGAC-CGAAUGACC
Cluster members
CAGUAAGAC-CGAAUGACC
1ffk:0, 552-587, 1ffk:0, 563-576, 1jj2:0, 553-588, 1jj2:0, 564-577, 1k73:A, 553-588, 1k73:A, 564-577, 1k8a:A, 553-588, 1k8a:A, 564-577, 1k9m:A, 553-588, 1k9m:A, 564-577, 1kc8:A, 553-588, 1kc8:A, 564-577, 1kd1:A, 553-588, 1kd1:A, 564-577, 1kqs:0, 553-588, 1kqs:0, 564-577, 1m1k:A, 553-588, 1m1k:A, 564-577, 1m90:A, 553-588, 1m90:A, 564-577, 1n8r:A, 553-588, 1n8r:A, 564-577, 1nji:A, 553-588, 1nji:A, 564-577, 1q7y:A, 553-588, 1q7y:A, 564-577, 1q81:A, 553-588, 1q81:A, 564-577, 1q82:A, 553-588, 1q82:A, 564-577, 1q86:A, 553-588, 1q86:A, 564-577, 1qvf:0, 553-588, 1qvf:0, 564-577, 1qvg:0, 553-588, 1qvg:0, 564-577, 1s72:0, 553-588, 1s72:0, 564-577, 1vq4:0, 553-588, 1vq4:0, 564-577, 1vq5:0, 553-588, 1vq5:0, 564-577, 1vq6:0, 553-588, 1vq6:0, 564-577, 1vq7:0, 553-588, 1vq7:0, 564-577, 1vq8:0, 553-588, 1vq8:0, 564-577, 1vq9:0, 553-588, 1vq9:0, 564-577, 1vqk:0, 553-588, 1vqk:0, 564-577, 1vql:0, 553-588, 1vql:0, 564-577, 1vqm:0, 553-588, 1vqm:0, 564-577, 1vqn:0, 553-588, 1vqn:0, 564-577, 1vqo:0, 553-588, 1vqo:0, 564-577, 1vqp:0, 553-588, 1vqp:0, 564-577, 1w2b:0, 553-588, 1w2b:0, 564-577, 1yhq:0, 552-589, 1yhq:0, 564-577, 1yi2:0, 552-589, 1yi2:0, 564-577, 1yij:0, 552-589, 1yij:0, 564-577, 1yit:0, 552-589, 1yit:0, 564-577, 1yj9:0, 552-589, 1yj9:0, 564-577, 1yjn:0, 552-589, 1yjn:0, 564-577, 1yjw:0, 552-589, 1yjw:0, 564-577, 2otj:0, 553-588, 2otj:0, 564-577, 2otl:0, 553-588, 2otl:0, 564-577, 2qex:0, 553-588, 2qex:0, 564-577, 3cc2:0, 552-589, 3cc2:0, 564-577, 3cc4:0, 552-589, 3cc4:0, 564-577, 3cc7:0, 552-589, 3cc7:0, 564-577, 3cce:0, 552-589, 3cce:0, 564-577, 3ccj:0, 553-588, 3ccj:0, 564-577, 3ccl:0, 552-589, 3ccl:0, 564-577, 3ccm:0, 552-589, 3ccm:0, 564-577, 3ccq:0, 552-589, 3ccq:0, 564-577, 3ccr:0, 552-589, 3ccr:0, 564-577, 3ccs:0, 552-589, 3ccs:0, 564-577, 3ccu:0, 552-589, 3ccu:0, 564-577, 3ccv:0, 552-589, 3ccv:0, 564-577, 3cd6:0, 552-589, 3cd6:0, 564-577, 3cma:0, 552-589, 3cma:0, 564-577, 3cme:0, 552-589, 3cme:0, 564-577, 3cpw:0, 553-588, 3cpw:0, 564-577