Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(7-7)-Internal loop cluster 40 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 56 structure(s)
Representative structure 1vs8:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GAUGGUA-GAGAGUA
Cluster members
GAUGGUA-GAGAGUA
1vs6:A, 69-105, 1vs6:A, 78-96, 1vs8:A, 69-105, 1vs8:A, 78-96, 2aw4:A, 69-105, 2aw4:A, 78-96, 2awb:A, 69-105, 2awb:A, 78-96, 2i2t:A, 69-105, 2i2t:A, 78-96, 2i2v:A, 69-105, 2i2v:A, 78-96, 2j28:A, 69-105, 2j28:A, 78-96, 2jl6:B, 69-108, 2jl6:B, 79-98, 2jl8:B, 69-108, 2jl8:B, 79-98, 2qam:A, 69-105, 2qam:A, 78-96, 2qao:A, 69-105, 2qao:A, 78-96, 2qba:A, 69-105, 2qba:A, 78-96, 2qbc:A, 69-105, 2qbc:A, 78-96, 2qbe:A, 69-105, 2qbe:A, 78-96, 2qbg:A, 69-105, 2qbg:A, 78-96, 2qbi:A, 69-105, 2qbi:A, 78-96, 2qbk:A, 69-105, 2qbk:A, 78-96, 2qov:A, 69-105, 2qov:A, 78-96, 2qox:A, 69-105, 2qox:A, 78-96, 2qoz:A, 69-105, 2qoz:A, 78-96, 2qp1:A, 69-105, 2qp1:A, 78-96, 2v47:B, 69-108, 2v49:B, 69-108, 2z4l:A, 69-105, 2z4l:A, 78-96, 2z4n:A, 69-105, 2z4n:A, 78-96, 3bbx:A, 69-105, 3bbx:A, 78-96, 3d5b:B, 69-108, 3d5d:B, 69-108, 3df2:A, 69-105, 3df2:A, 78-96, 3df4:A, 69-105, 3df4:A, 78-96