Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(5-7)-Internal loop cluster 118 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 120 structure(s)
Representative structure 1yi2:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GCAAA-CUCGUAC
Cluster members
GCAAA-CUCGUAC
1ffk:0, 1769-1804, 1ffk:0, 1781-1790, 1jj2:0, 1819-1854, 1jj2:0, 1831-1840, 1k73:A, 1819-1854, 1k73:A, 1831-1840, 1k8a:A, 1819-1854, 1k8a:A, 1831-1840, 1k9m:A, 1819-1854, 1k9m:A, 1831-1840, 1kc8:A, 1819-1854, 1kc8:A, 1831-1840, 1kd1:A, 1819-1854, 1kd1:A, 1831-1840, 1kqs:0, 1819-1854, 1kqs:0, 1831-1840, 1m1k:A, 1819-1854, 1m1k:A, 1831-1840, 1m90:A, 1819-1854, 1m90:A, 1831-1840, 1n8r:A, 1819-1854, 1n8r:A, 1831-1840, 1nji:A, 1819-1854, 1nji:A, 1831-1840, 1q7y:A, 1819-1854, 1q7y:A, 1831-1840, 1q81:A, 1819-1854, 1q81:A, 1831-1840, 1q82:A, 1819-1854, 1q82:A, 1831-1840, 1q86:A, 1819-1854, 1q86:A, 1831-1840, 1qvf:0, 1819-1854, 1qvf:0, 1831-1840, 1qvg:0, 1819-1854, 1qvg:0, 1831-1840, 1s1i:3, 1927-1962, 1s1i:3, 1939-1948, 1s72:0, 1819-1854, 1s72:0, 1831-1840, 1vq4:0, 1819-1854, 1vq4:0, 1831-1840, 1vq5:0, 1819-1854, 1vq5:0, 1831-1840, 1vq6:0, 1819-1854, 1vq6:0, 1831-1840, 1vq7:0, 1819-1854, 1vq7:0, 1831-1840, 1vq8:0, 1819-1854, 1vq8:0, 1831-1840, 1vq9:0, 1819-1854, 1vq9:0, 1831-1840, 1vqk:0, 1819-1854, 1vqk:0, 1831-1840, 1vql:0, 1819-1854, 1vql:0, 1831-1840, 1vqm:0, 1819-1854, 1vqm:0, 1831-1840, 1vqn:0, 1819-1854, 1vqn:0, 1831-1840, 1vqo:0, 1819-1854, 1vqo:0, 1831-1840, 1vqp:0, 1819-1854, 1vqp:0, 1831-1840, 1w2b:0, 1819-1854, 1w2b:0, 1831-1840, 1yhq:0, 1819-1854, 1yhq:0, 1831-1840, 1yi2:0, 1819-1854, 1yi2:0, 1831-1840, 1yij:0, 1819-1854, 1yij:0, 1831-1840, 1yit:0, 1819-1854, 1yit:0, 1831-1840, 1yj9:0, 1819-1854, 1yj9:0, 1831-1840, 1yjn:0, 1819-1854, 1yjn:0, 1831-1840, 1yjw:0, 1819-1854, 1yjw:0, 1831-1840, 2otj:0, 1819-1854, 2otj:0, 1831-1840, 2otl:0, 1819-1854, 2otl:0, 1831-1840, 2qa4:0, 1824-1859, 2qa4:0, 1836-1845, 2qex:0, 1819-1854, 2qex:0, 1831-1840, 3cc2:0, 1819-1854, 3cc2:0, 1831-1840, 3cc4:0, 1819-1854, 3cc4:0, 1831-1840, 3cc7:0, 1819-1854, 3cc7:0, 1831-1840, 3cce:0, 1819-1854, 3cce:0, 1831-1840, 3ccj:0, 1819-1854, 3ccj:0, 1831-1840, 3ccl:0, 1819-1854, 3ccl:0, 1831-1840, 3ccm:0, 1819-1854, 3ccm:0, 1831-1840, 3ccq:0, 1819-1854, 3ccq:0, 1831-1840, 3ccr:0, 1819-1854, 3ccr:0, 1831-1840, 3ccs:0, 1819-1854, 3ccs:0, 1831-1840, 3ccu:0, 1819-1854, 3ccu:0, 1831-1840, 3ccv:0, 1819-1854, 3ccv:0, 1831-1840, 3cd6:0, 1819-1854, 3cd6:0, 1831-1840, 3cma:0, 1819-1854, 3cma:0, 1831-1840, 3cme:0, 1819-1854, 3cme:0, 1831-1840, 3cpw:0, 1819-1854, 3cpw:0, 1831-1840