Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(5-6)-Internal loop cluster 139 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 84 structure(s)
Representative structure 1pnx:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GUAAA-GAAGAA
Cluster members
GUAAA-GAAGAA
1fjg:A, 397-427, 1fjg:A, 407-418, 1hnw:A, 397-427, 1hnw:A, 407-418, 1hnx:A, 397-427, 1hnx:A, 407-418, 1hnz:A, 397-427, 1hnz:A, 407-418, 1hr0:A, 397-427, 1hr0:A, 407-418, 1i94:A, 400-430, 1i94:A, 410-421, 1i95:A, 400-430, 1i95:A, 410-421, 1i96:A, 400-430, 1i96:A, 410-421, 1ibk:A, 397-427, 1ibk:A, 407-418, 1ibl:A, 397-427, 1ibl:A, 407-418, 1ibm:A, 397-427, 1ibm:A, 407-418, 1j5e:A, 397-427, 1j5e:A, 407-418, 1n32:A, 397-427, 1n32:A, 407-418, 1n33:A, 397-427, 1n33:A, 407-418, 1pns:A, 401-431, 1pns:A, 411-422, 1pnx:A, 401-431, 1pnx:A, 411-422, 1s1h:A, 402-432, 1s1h:A, 412-423, 1yl4:A, 397-427, 1yl4:A, 407-418, 2b64:A, 397-427, 2b64:A, 407-418, 2b9m:A, 397-427, 2b9m:A, 407-418, 2b9o:A, 397-427, 2b9o:A, 407-418, 2e5l:A, 398-428, 2e5l:A, 408-419, 2hgi:A, 397-427, 2hgi:A, 407-418, 2hgp:A, 397-427, 2hgp:A, 407-418, 2hgr:A, 397-427, 2hgr:A, 407-418, 2hhh:A, 397-427, 2hhh:A, 407-418, 2j00:A, 397-427, 2j00:A, 407-418, 2j02:A, 397-427, 2j02:A, 407-418, 2jl5:A, 397-427, 2jl5:A, 407-418, 2jl7:A, 397-427, 2jl7:A, 407-418, 2qb9:A, 402-432, 2qb9:A, 412-423, 2qbb:A, 402-432, 2qbb:A, 412-423, 2uu9:A, 397-427, 2uu9:A, 407-418, 2uua:A, 397-427, 2uua:A, 407-418, 2uub:A, 397-427, 2uub:A, 407-418, 2uuc:A, 397-427, 2uuc:A, 407-418, 2v46:A, 397-427, 2v46:A, 407-418, 2v48:A, 397-427, 2v48:A, 407-418, 2vqe:A, 397-427, 2vqe:A, 407-418, 2vqf:A, 397-427, 2vqf:A, 407-418, 3d5a:A, 397-427, 3d5a:A, 407-418, 3d5c:A, 397-427, 3d5c:A, 407-418